Pines GPIO seguros
Todos los pines digitales y analógicos funcionan con lógica nativa de 5,0 V con un límite continuo recomendado de 20 mA por pin (máximo absoluto de 40 mA). Límite total del chip: 200 mA.
Pines ADC y analógicos
16 canales analógicos (A0–A15, resolución de 10 bits de 0 a 5V o AREF externo). Los canales A4–A7 están multiplexados con la interfaz JTAG (TCK, TMS, TDO, TDI).
Pines I2C, SPI y UART
4 puertos UART por hardware: Serial0 (D0/D1), Serial1 (D19/D18), Serial2 (D17/D16), Serial3 (D15/D14). Bus SPI en los pines D50 (MISO), D51 (MOSI), D52 (SCK), D53 (SS) y conector ICSP (¡NO en los pines 10-13!). I2C en D20 (SDA) y D21 (SCL).
Pines de configuración y arranque
Sin pines strapping. El pin D13 está conectado al LED amarillo 'L' mediante un búfer operacional LMV358. D0/D1 están conectados al puente USB-serie ATmega16U2.
Pines de solo entrada
Los 54 pines digitales admiten E/S bidireccional con resistencias pull-up internas (20–50 kΩ). 15 pines ofrecen PWM por hardware de 8/16 bits (D2–D13, D44–D46). 6 pines disponen de interrupciones externas por hardware (D2, D3, D18, D19, D20, D21).